Em Alexandria , vivia uma mulher chamada Hipátia, filha do filósofo Teon, que alcançou tais feitos na literatura e na ciência que superou em muito todos os filósofos de sua época. Tendo seguido os passos de Platão e Plotino, ela explicava os princípios da filosofia a seus ouvintes, muitos dos quais vinham de longe para receber seus ensinamentos. Devido à autoconfiança e à desenvoltura que adquirira em consequência do cultivo de sua mente , não era raro que comparecesse em público na presença dos magistrados. Tampouco se sentia constrangida em comparecer perante uma assembleia de homens, pois todos , por conta de sua extraordinária dignidade e virtude, a admiravam ainda mais. Contudo, mesmo ela foi vítima da inveja política que prevalecia na época. Como se encontrava frequentemente com Orestes, espalhou-se caluniosamente entre o povo cristão o boato de que fora ela quem impedira a reconciliação de Orestes com o bispo . Alguns deles, movidos por um zelo feroz e fanático , liderados por um leitor chamado Pedro, emboscaram-na quando ela voltava para casa e, arrastando-a da carruagem, levaram-na para a igreja chamada Cesareu , onde a despiram completamente e a assassinaram com telhas. Depois de esquartejarem seu corpo, levaram seus membros mutilados para um lugar chamado Cinaron e lá os queimaram. Esse episódio trouxe grande opróbrio, não só para Cirilo, mas também para toda a igreja de Alexandria . E certamente nada pode estar mais distante do espírito do cristianismo do que a permissão de massacres, brigas e atos dessa natureza. Isso aconteceu no mês de março, durante a Quaresma, no quarto ano do episcopado de Cirilo , sob o décimo consulado de Honório e o sexto de Teodósio.