Quando se passaram quinze dias do prazo estipulado, os bispos que se reuniram para tratar deste assunto, considerando que os orientais não se juntariam a eles, ou, pelo menos, não o fariam após uma demora considerável, realizaram um conclave sob a presidência do divino Cirilo, ocupando o posto de Celestino, que, como já foi mencionado, era bispo da Roma Antiga. Assim, convocaram Nestório, exortando-o a se defender das acusações. Contudo, apesar da promessa feita no dia anterior de que compareceria se houvesse ocasião, ele não apareceu, mesmo tendo sido convocado três vezes. A assembleia, então, procedeu à investigação do caso. Mêmnon, presidente da igreja de Éfeso, relatou os quinze dias decorridos; em seguida, foram lidas as cartas endereçadas a Nestório pelo divino Cirilo e suas réplicas, sendo também inserida a sagrada epístola do ilustre Celestino ao próprio Nestório. Teódoto, bispo de Ancira, e Acácio, de Melitene, também detalharam a linguagem blasfema que Nestório proferiu sem reservas em Éfeso. A estas somaram-se muitas declarações em que santos padres expuseram a verdadeira fé, tendo lado a lado várias blasfêmias que o delírio do ímpio Nestório proferiu. Feito tudo isso, o santo sínodo declarou seu julgamento precisamente nos seguintes termos: "Visto que, além das outras questões, o reverendíssimo Nestório recusou-se a submeter-se à nossa convocação, ou mesmo a admitir os santíssimos e piedosos bispos que nos foram enviados, procedemos necessariamente à investigação de suas impiedades; e tendo-o condenado por nutrir e professar sentimentos ímpios, com base nas evidências de suas cartas e escritos que foram lidos, e também nas palavras proferidas por ele recentemente nesta cidade metropolitana, e estabelecidas por testemunho suficiente, enfim, compelidas pelos cânones, e de acordo com a epístola de nosso santíssimo pai e companheiro de ministério, Celestino, bispo da Igreja de Roma, procedemos, com muitas lágrimas, a esta triste sentença. O Senhor Jesus Cristo, que foi blasfemado por ele, decretou, por intermédio deste santo sínodo, que o mesmo Nestório está afastado da dignidade episcopal e de toda assembleia sacerdotal."