Não muito tempo depois disso, os monges do deserto , juntamente com Dióscoro e seus irmãos, chegaram a Constantinopla. Estava também com eles Isidoro, outrora o amigo mais íntimo do bispo Teófilo, mas que se tornara seu inimigo mais ferrenho, devido à seguinte circunstância: um certo homem chamado Pedro era, naquela época, o arquipresbítero da igreja de Alexandria ; Teófilo, irritado com essa pessoa, resolveu expulsá-lo da igreja; e, como motivo para a expulsão, acusou-o de ter admitido à participação nos sagrados mistérios uma mulher da seita maniqueísta , sem antes obrigá-la a renunciar à sua heresia maniqueísta . Quando Pedro, em sua defesa, declarou que não só os erros dessa mulher já haviam sido repudiados, mas que o próprio Teófilo havia autorizado sua admissão à eucaristia, Teófilo ficou indignado, como se tivesse sido gravemente caluniado . Então, ele afirmou que desconhecia completamente a circunstância. Pedro, portanto, convocou Isidoro para testemunhar sobre o conhecimento do bispo a respeito dos fatos relativos à mulher . Ora, Isidoro encontrava-se então em Roma , em missão de Teófilo a Dâmaso, o prelado da cidade imperial, com o propósito de promover uma reconciliação entre este e Flaviano, bispo de Antioquia ; pois os partidários de Meleto haviam se separado de Flaviano em repúdio ao seu perjúrio , como já observamos. Quando Isidoro retornou de Roma e foi citado como testemunha por Pedro, depôs que a mulher fora recebida com o consentimento do bispo e que ele próprio lhe administrara o sacramento. Diante disso, Teófilo enfureceu-se e, tomado pela raiva, expulsou ambos. Isso explicou a razão pela qual Isidoro foi a Constantinopla com Dióscoro e seus companheiros, a fim de apresentar ao imperador, e ao bispo João , a injustiça e a violência com que Teófilo os havia tratado. João, ao ser informado dos fatos, deu aos homens uma recepção honrosa e não os excluiu da comunhão nas orações , mas adiou a comunhão dos sagrados mistérios . até que seus assuntos fossem examinados. Enquanto as coisas estavam nessa situação, um falso boato chegou aos ouvidos de Teófilo, de que João os havia admitido à participação nos mistérios e também estava pronto para ajudá-los; por isso, ele resolveu não apenas se vingar de Isidoro e Dióscoro, mas também, se possível, expulsar João de sua cátedra episcopal. Com esse desígnio, escreveu a todos os bispos das várias cidades e, ocultando seu verdadeiro motivo, condenou ostensivamente os livros de Orígenes : os mesmos que Atanásio, seu predecessor, havia usado para confirmar sua própria fé , frequentemente apelando ao testemunho e à autoridade dos escritos de Orígenes em seus discursos contra os arianos .